Панель Наследственный рак

Панель «Все виды наследственного рака» позволяет установить наличие врожденных (герминальных) патогенных мутаций в 137 генах, достоверно ассоциированных практически со всеми известными наследственными формами рака. Примерно 5–15% случаев злокачественных новообразований являются наследственными и обусловлены наличием мутаций в определенных генах.

Наследственные опухолевые синдромы ассоциированы с повышенным риском развития рака у пациента. Во многих случаях у носителей патогенной мутации опухоли развиваются в более раннем возрасте, а также нередки случаи образования нескольких первичных опухолей у одного пациента.

К примеру, при семейном аденоматозном полипозе риск развития рака толстой кишки у пациентов в возрасте 40 лет достигает 100% в случае, если не была проведена профилактическая колэктомия. У пациентов с синдромом Линча рак толстой кишки в течение жизни развивается в 80% случаев, рак эндометрия – в 43% случаев, рак желудка – в 19% случаев. Вероятность развития рака молочной железы у пациентов с синдромом Коудена составляет 30–50%.

Правильная постановка диагноза в случае наследственных опухолевых синдромов, основанная на выявлении мутаций в соответствующих генах, позволяет оценить риск развития рака, а также определить меры по ранней диагностике или предотвращению образования опухоли.

Показания для проведения исследования

• Пациент с диагнозом рак в необычно молодом возрасте, на 10–15 лет раньше, чем спорадическая опухоль, чаще всего до 50 лет.
• Наличие первично-множественных опухолей (билатеральные, синхронные, метахронные опухоли).
• Определенный гистологический вариант опухоли (например, трижды негативный рак молочной железы, медуллярный рак щитовидной железы).
• Наличие у пациента или родственников еврейского происхождения Ашкенази при раке молочной железы или яичников.
• Наличие в семейном анамнезе наследственных опухолевых синдромов (синдром Линча, синдром Коудена, семейный аденоматозный полипоз и др.).
• Аденоматозный полипоз неизвестной этиологии.
• Профилактическое обследование здорового человека, обеспокоенного рисками развития онкологического заболевания в течение жизни.

Метод исследования и клиническая эффективность

В основе диагностики с использованием панели «Все виды наследственного рака» лежит метод высокопроизводительного секвенирования ДНК (Next Generation Sequencing, NGS) со средним покрытием в кодирующих областях генов и сайтах сплайсинга не менее 80х.

Ограничения метода

Метод не выявляет генетические варианты в повторяющихся участках генома (гены с псевдогенами, паралогами, сегментарными повторами). Точность метода также снижена в сложных участках генома (GC-богатые и poly-n области).

Заключение по результатам исследования

В заключение включаются патогенные, вероятно-патогенные генетические варианты и варианты с неизвестным клиническим значением, их описание и интерпретация.

Также выдается файл со списком всех вариантов, обнаруженных в исследуемых генах.

Гены, входящие в исследование и ассоциированные синдромы

AL?K, APC, ATM, ATR, AXIN2, BAP1, BARD1, BLM, BMPR1A, BRAF, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CDC73, CDH1, CDK4, CDKN1B, CDKN2A, CTNNA1, CEBPA, CHEK2, DDB2, DDX41, DICER1, DNAJC21, EGFR, EPCAM, ERCC1, ERCC2, ERCC3, ERCC4, ERCC5, EXO1, EXT1, EXT2, EZH2, FAM111B, FANCA, FANCB, FANCC, FANCD2, FANCE, FANCF, FANCG, FANCI, FANCL, FANCM, FH, FLCN, GALNT12, GATA2, GREM1, HOXB13, HRAS, ITK, JAK2, KCNN4, KIF1B, KIT, KRAS, LZTR1, MAGT1, MAP2K1, MAP2K2, MAX, MEN1, MET, MITF, MLH1, MLH3, MPL, MRE11A, MSH2, MSH3, MSH6, MUTYH, NBN, NF1, NF2, NRAS, NTHL1, PALB2, PAX5, PDGFRA, PHOX2B, PMS1, PMS2, POLD1, POLE, POLH, POT1, PPM1D, PRF1, PRKAR1A, PTCH1, PTEN, PTPN11, RAD50, RAD51C, RAD51D, RAF1, RB1, RECQL, REST, RET, RHBDF2, RPS20, RUNX1, SAMD9, SAMD9L, SBDS, SDHA, SDHAF2, SDHB, SDHC, SDHD, SH2D1A, SLX4, SMAD4, SMARCA4, SMARCB1, SMARCD2, SMARCE1, SPRED1, STK11, SUFU, TERT, TMEM127, TP53, TSC1, TSC2, UBE2T, VHL, XIAP, XPA, XPC, XRCC2.